"磷酸化被扩展到MRD样品的蓬勃发展前景是明确的，希望这些成效将此后增加未来MRD样品的效率。"
此前列腺癌的MRD样品是一种灵敏且特异的运用于天气预报此前列腺癌病人肝脏当中源性遗传物质（如ctDNA）相对数量的作法。在这种状态下，病人没有肉眼可见的溃疡，但确实假定标准诊疗影像作法未曾样品到但之后不会导致此前列腺癌患上的均匀分布溃疡。
MRD，经常统称均匀分布残存溃疡（Minimal Residual Disease）。可用“Minimal” （均匀分布）这个词，是因为它在文献和诊疗研究专家当中更是都用。不过，“Minimal”这个词或许具有“误导性”，因为低总体的病因在病因和疗法决策方面也或许具有重要意义。“Measurable”（可测量）一词可更是仍要确地描绘残存在病人体内的肿瘤细胞的假定。NCCN指南同时可用了“Minimal Residual Disease”（均匀分布残存溃疡）和“Measurable Residual Disease”（可测量残存溃疡）两个术语。
此除此以外，环评者表明在分子结构总体上样品多种此前列腺癌子类的ctDNA同样具有诊疗效用，文献和诊疗研究专家有时也不会可用“Molecular Residual Disease”（分子结构残存溃疡）一词。
近来，国内除此以外在之外当中基于ctDNA的MRD安全性评估（ctDNA-MRD）的诊疗数据和结论更为多，带进了之外疣MRD样品的热潮。之外疣ctDNA-MRD样品的系统新设计流派主要有两大类：
1）Tumor-informed assays（知情分析方法）
对原发秘密组织展开DNA组以比对病人的特异遗传物质变异图谱，然后新设计聚合酶定制panel或可用浮动panel展开个人化的ctDNA样品分析方法。
2）Tumor-uninformed assays（知情分析方法）
也可以统称Tumor-agnostic assays或Tumor-naïve assays，即不须原发秘密组织，仅有发挥作用举例来说预先选定聚合酶/探针新设计的与此前列腺癌子类相关的浮动panel展开ctDNA样品分析方法，往经常样品ctDNA基因突变的同时，辅以ctDNA磷酸化或片段组习等多组习作法。太少了秘密组织抽取不足或天气预报亚基不足或TAT过长等问题。
Tumor-informed assays的系统新设计方式而更是符合大众的认知，在保证很高酪氨酸的先决必要条件下，可通过天气预报多亚基的sample-level（抽取总体）大幅度增加其频率，系统新设计比率来得不是特别很高。Tumor-uninformed assays的系统新设计方式而更是类似早筛，通过增加site-level（亚基总体）样品频率并辅以ctDNA磷酸化或片段组习并经常为合机器习习算法大幅度增加其频率和酪氨酸，系统新设计比率来得较很高。
2021年4月底29日，《Clinical Cancer Research》在线刊发了“仅有可用人体内ctDNA样品经常为肺癌病人均匀分布残存溃疡（MRD）”的社论，首次公开了Guardant Reveal的研究成果数据：MRD样品频率达到91%，酪氨酸达100%，这些发现全力支持了仅有人体内ctDNA-MRD样品（Tumor-uninformed assays）的潜在诊疗运运用于。
2021年8月底13日，《Clinical Cancer Research》在线刊发了“顺应潮流：仅有人体内ctDNA-MRD样品的运运用于此前景”的社论，在这里研究成果者们讨论安全性评估了仅有人体内ctDNA样品MRD的能力，以及将磷酸化定位到ctDNA样品的潜在好处。2
Parikh及其朋友1 和Taieb及其朋友3 讨论了仅有人体内ctDNA-MRD样品在经常为肺癌（CRC）病人当中的潜在诊疗运运用于。
▲ ctDNA磷酸化和基因突变在两项研究成果当中的运运用于来得（Parikh和Taieb）
经常为肺癌（CRC）的疗法即便如此接踵而来着一个挑战，即众多的CRC病人因最初疾病患上而过早死亡。尽管诊疗选用了标准的特别新设计疗法，但很高安全性IIIC期CRC病人的5年生存率也仅有有53%，话虽如此是没有发现放大镜上未曾样品到的均匀分布残存溃疡（MRD）。4
目此前，仍迫切并不需要仍要确断定哪些病人术后假定MRD，以尽力指导增加或上升特别新设计疗法，并上升救活的或许性，同时最大限度地增加但会疗法的相关毒性。
在过去的几年里，我们对ctDNA在CRC诊断和病因当中的运运用于有了众多的明白。目此前，基于ctDNA的MRD安全性评估仍要众多运运用于于此前列腺癌的疗法当中。
ctDNA是由DNA的动画短片段均是由（约130-150bp），由肿瘤细胞通过凋亡、坏死或分泌拘押到泌尿系统当中。 ctDNA的寿命较短情况严重其视为极端的实时负载；也，它的假定或许反映了放大镜上看不见的透重新分配。
在救活性疗法经常为束后，ctDNA当中出现的线粒体基因突变对随后的放大镜患上具有较很高的无症状分析实用性，特别是当这些基因突变与摘除的秘密组织当中的基因突变相匹配时。样品这种ctDNA定义的MRD可以在I-III期CRC当中提此前放大镜数月底分析患上，从而为举例来说之后不会患上的CRC病人共享一个安全性评估新疗法的窗口。然而，这些ctDNA经济制度基因突变定义的MRD样品作法的频率即便如此是有限的，迫切并不需要加以改进其样品效率。
ctDNA的磷酸化样品优于ctDNA的经济制度基因突变样品。ctDNA的磷酸化异往经常CRC当中非经常经常见，并被视为大多数细菌感染的最初阶段。这种磷酸化，具体定义为DNA当中核苷酸的C5位置附加甲基底物，调节附近DNA的表达，仅有限于经典的抑癌DNA失活。与经济制度基因突变来得，CRC当中假定更是多的磷酸化反经常区域，为增加MRD样品的频率共享了机不会。SEPT9，就是第一个利用肝脏样品单DNA磷酸化反经常展开筛查和最初样品CRC的作法。尽管ctDNA磷酸化有这些优点，但这些相同的物理性质也并不需要谨慎，以保持样品分析方法的酪氨酸，并尽量增加假无症状的或许性。
在这种剧当中下，Parikh和Taieb的这两项同子类研究成果经常为果为我们对ctDNA效率的解释共享了有用的缺少，即不须原发秘密组织，仅有通过肝脏ctDNA磷酸化或建立联系ctDNA基因突变只需展开仍要确的MRD安全性评估。与其他并不需要对原发秘密组织展开DNA组以指导后续ctDNA分析方法的样品不同，这两项研究成果探讨了Tumor-uninformed assays的实证，它有几个优势，仅有限于并能的TAT，降低初始运输成本，对秘密组织不足或不可用的病人展开天气预报。
Parikh等人共享了一种ctDNA磷酸化经常为合ctDNA经济制度基因突变的浮动panel展开MRD的分析方法安全性评估（NGS作法），与其他商业上可用的MRD样品作法来得，这种作法不并不需要摘除的秘密组织以及定制化。在之后疗法后可用时，这种仅有人体内ctDNA-MRD样品对患上具有诊疗意义的酪氨酸（100%）和频率（55.6%），通过定位一般说来遗传物质形态和纵向天气预报分析方法，其频率可大幅度增加至91%。1 该作法被运用于仍要在展开的此前瞻性研究成果，仅有限于指导IIA期经常为肠癌疗法决策的NRG合作组研究成果（NCT04068103）。虽然还并不需要额除此以外的数据集来证明这些发现，但这些经常为果证明了基于ctDNA的MRD样品在知情的情况下可不能接受的样品效率形态。
Taieb等人的研究成果利用了一对先此前被证明是CRC摘除后病因相关的磷酸化DNA标上物WIF1和NPY（ddPCR作法），并将它们运运用于于PRODIGE-GERCOR IDEA-France检验，将III期CRC病人随机分为3个月底 vs 6个月底的特别新设计化学治疗。在对直接参与III期检验的III期CRC病人展开的首次ctDNA-MRD安全性评估当中，有13.8%的病人术后为ctDNA-MRD无症状，并被确认为统一的病因；也。3 同时，研究成果者也指出，与其他选用NGS作法的ctDNA-MRD研究成果来得，本研究成果当中ctDNA的无症状率高。频率和PPV同样低于NGS样品经常为果，ctDNA-MRD无症状和形容词的5年DFS分别为65%和73%，尽管特别新设计疗法的和不理想的此前分析方法抽取处理或许不会对这些经常为果产生影响。该作法值得注意的是其相对比较简单，非经常低的运输成本和潜在的重现性，不并不需要商业样品当中所见的商标注册样品作法。仍要在展开的此前瞻性研究成果将大幅度安全性评估仅有人体内ctDNA样品到底能够仍要确安全性评估MRD，以便对CRC病人展开安全性由上而下，并指导特别新设计疗法决策。
无论选用何种作法，仅有用人体内ctDNA-MRD样品来指导CRC病人的疗法提议，并不需要可信且仍要确的样品作法。需大幅度增加仅有人体内ctDNA-MRD样品的频率来断定哪些病人可以从疗法降级当中获益，以消除不恰当地选择很高危病人不能接受高强度的疗法。Parikh及其朋友的研究成果经常为果表明，定位遗传物质和一般说来遗传物质以及纵向人体内天气预报，可显著增加仅有人体内ctDNA-MRD的频率。来得之下，ctDNA-MRD样品的很高酪氨酸对于ctDNA作为一个完整的生物；也来断定疗法更新是至关重要的。由于酪氨酸不足，假无症状的ctDNA-MRD或许不会使病人不能接受但会的强化学治疗法。Parikh及其朋友的研究成果经常为果证明，除经济制度基因突变除此以外，还可以通过经常为合一般说来遗传物质磷酸化形态的分析方法来保持酪氨酸。Taieb等人的分析方法作法的优势在于增加了诊疗形态的频率和病因，但是，仍要如研究成果者承认的那样，之外的两个DNA磷酸化标上或许未曾共享与经常为合经济制度基因突变作法的效率形态。重要的是，这项文书工作也强调了标准化分析方法此前必要条件的普遍性，因为各种所含作法可以在很大程度上影响ctDNA的得率和仍要确性。在未曾来的研究成果当中，这些分析方法此前的考虑将变得更为重要。
磷酸化被扩展到MRD样品的蓬勃发展前景是明确的，希望这些成效将此后增加未来MRD样品的效率。总之，仅有人体内ctDNA-MRD的样品共享了一个新颖的机不会，可用一种无创作法来聚焦疗法方案，并有或许消除很高危病人的透重新分配性溃疡。这些研究成果经常为果不可否认为未曾来ctDNA-MRD指导的此前瞻性诊疗检验铺平了道路。
MRD，即便如此是一个并能蓬勃发展的领域，我们预计近两年或许不会出现新的结论，要么显示出MRD样品的诊疗效用的局限性，要么显示出MRD样品的其他优势和新用途。
参考资料：
1.Parikh Aparna R,Van Seventer Emily E,Siregna Giulia et al. Minimal Residual Disease Detection using a Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assay in Colorectal Cancer Patients.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.
2.Bent A, Kopetz S. Going with the Flow: The Promise of Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assays. Clin Cancer Res. 2021 Oct 15;27(20):5449-5451.
3.Taieb Julien,Taly Valerie,Henriques Julie et al. Prognostic value and relation with adjuvant treatment duration of ctDNA in stage III colon cancer: a post-hoc ysis of the PRODIGE-GERCOR IDEA-France trial.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.
4.Benson Al B,Venook Alan P,Cederquist Lynette et al. Colon Cancer, Version 1.2017, NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology.[J] .J Natl Compr Canc Netw, 2017, 15: 370-398.
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